严重急性附睾炎不可逆的终末期即为慢性附睾炎，此时可经常出现较急性附睾炎症状轻的表现。慢性附睾炎由于纤维增生使整个附睾硬化，显微镜下疤痕非常显著，常可看到附睾管闭塞，组织被淋巴细胞和浆细胞浸润。
(一)症状慢性附睾炎通常无症状，除非有急性发作的情况，此时可出现局部不适，病人可触及阴囊内有一肿块，附睾增厚并增大，有或无压痛，触诊极易将附睾与睾丸区分开，精索往往增粗，有时输精管直径增大，前列腺变硬并有纤维化，前列腺液常可见脓细胞，尿液分析可显示继发于前列腺炎的感染。
结核性附睾炎与慢性附睾炎很相似，输精管呈串珠状，同时精囊增厚，尿液检查为“无菌尿”，或“结核菌尿”，由此可提示为结核性附睾炎，膀胱镜可见膀胱溃疡，尿路X线检查也可帮助诊断。睾丸肿瘤可有睾丸包块，触诊可发现增厚变硬的附睾，感觉减退的睾丸(肿瘤)。附睾肿瘤少见，与附睾炎鉴别需依靠病理。如果慢性附睾炎为双侧，可导致不育。
(二）治疗单用抗生素往往治疗效果不满意，前列腺炎必须控制，如附睾炎反复发作引起前列腺炎应在非发作期行输精管结扎术，前列腺炎可治愈，有时也可行附睾切除术。
(三)预后
除了疼痛及双侧附睾炎可能致不育外，慢性附睾炎无严重后果，一旦达纤维化期，则无法使其逆转。
